Mỗi PIC II là một tập hợp các yếu tố phiên mã chung (GTF), gồm khoảng hàng chục đến hàng trăm phân tử, đã được nghiên cứu kỹ qua kính hiển vi điện tử.[2]
Ở nấm Saccharomyces cerevisiae, các thành phần chủ yếu của tập hợp này gồm 32 prôtêin, với khối lượng khoảng 1,5 megaDalton và lõi trung gian (Mediator) có độ phân giải danh nghĩa 4,7 Å và 5,8 Å. Các yếu tố phiên mã (transcription factors, viết tắt là TF) gồm các loại kí hiệu là TFIIB, -D, -E, -F và -H.[2][4]
Ngoài ra còn cần có enzym kinase giúp việc "mở" promoter của gen cần phiên mã và quá trình phosphoryl hóa của Pol II do các nhân tố khác tham gia. Tiểu đơn vị TFIIH - Ssl2 (tương đồng với XPB của người) định vị ở vùng hạ lưu của gen cần phiên nhờ cấu trúc xoắn ốc 'E-bridge' ở TFIIE.[5]
Các nhân tố khác như nhân tố kích hoạt (activator) v.v.[6]
